در بخش اندوسکوپی و اندامهای داخلی حیوانات خانگی بیمارستان دامپزشکی شبانه روزی درین امکان تشخیص ضایعات داخل بدن حیوان بدون آسیب و مداخله جراحی امکان تشخیص و درمان فراهم گردیده
در این قسمت امکان انجام اندوسکوپی جهت تشخیص ضایعات داخل بدن بدون آسیب و مداخله جراحی وجود دارد که روند تشخیصی بسیاری از بیماریها ی داخلی را به سرعت و بدون اسیب رسانی فراهم مینماید . اندوسکوپی در این مرکز زیر نظر متخصص مربوطه انجام می گیرد.
بخش اندوسکوپی بیمارستان دامپزشکی درین مجهز به مدرنترین دستگاه های الکترو کوتربای پلار و مونوپلار جهت انجام الکترو سرجری واندوسکوپ به منظور بررسی ارگان های داخلی می باشد.